简单的说，二级域名可以说是独立的网站，对优化关键词排名比较有优势，二级目录是属于主网站的，增加网站内容收录，权重方面不如二级。二级域名比二级目录天生的信任度稍微高一点，只能说每个方法都有各自的优势，看是搭建什么样的站。
二级域名优势：
二级域名会承担独立权重，和主域名无关。
二级域名是完全独立的网站，相对不会分散首页的权重
二级域名，在搜索引擎看来是一个新的独立网站，网站权重、PR值之类的，要重头培养。
二级域名用来优化的高难度的关键词的话，多少会继承主域名的权重，相当于一个独立的站点。
二域名搭建的站点，管理起来比二级目录更方便的，网站流量非常大的话，也适合使用二级域名搭建网站，分担流量压力。
二级域名缺点：
二级域名的使用会使网站变多，但同时使网站变小。
二级域名刚开始权重要低，后期权重和收录会很高。
二级目录优势：
二级目录当面临高难度的关键词时候，比起二级域名优势不明显。
二级目录虽然比较难做友情链接，但也可以通过与对方网站做交叉连接得以解决。
二级目录是属于主站下面的一个页面，多少会继承首页的权重，增加网站收录量。
二级目录则是继承主域名的权重，相当于在网站的根目录下再建立一个文件夹存放网站，一般而言更加容易被搜索引擎收录。
二级目录缺点：
二级目录是一个子文件夹，会分散首页的权重。
二级目录前期收录快，后期排名和权重没有二级域名高。
